Sistem Click Popularity sangat rentan terhadap manipulasi. klik dibayar melalui generator klik, menciptakan program penipuan melakukan klik berulang kali pada interval tertentu, dapat dengan mudah mendistorsi hasil. Metode peringkat ini juga mengandaikan bahwa pengguna akan kembali ke mesin pencari. Tapi itu sering terjadi bahwa pencarian dibatalkan setelah hasil pencarian pertama telah dilihat. Pengukuran durasi kunjungan terdistorsi oleh faktor alam seperti gangguan, istirahat makan siang dll situs-situs baru tidak akan mampu bersaing dengan situs yang sudah mapan yang memiliki banyak klik tidak peduli seberapa baik konten mereka. Selain itu, ada kritik bahwa tingkat klik juga dipengaruhi untuk sebagian besar dalam hasil pencarian, dan dengan demikian tidak dapat menjadi kriteria independen untuk nilai dari sebuah situs web.
